medical term
Metabolomikk
məˌtæbəˈloʊmɪks
Også kjent som: Metabolittprofilering, Metabolsk profilering
Oversikt
Metabolomikk er en av «omikk»-vitenskapene, ved siden av genomikk (studiet av gener) og proteomikk (studiet av proteiner). Målet er å gi et helhetlig øyeblikksbilde av de kjemiske prosessene som definerer liv. Samlingen av alle metabolitter i en biologisk prøve kalles metabolomet. I motsetning til genomet, som er relativt statisk, er metabolomet svært dynamisk. Det endrer seg som følge av genetiske faktorer, kosthold, livsstil og miljøpåvirkning. Disse små molekylene omfatter aminosyrer, lipider, sukker og nukleotider. De er sluttproduktene av cellulære reguleringsprosesser, og nivåene deres kan ses som en direkte avlesning av en organismes fysiologiske eller patologiske tilstand.
For å analysere det store og komplekse utvalget av molekyler i metabolomet bruker forskere kraftige analytiske teknikker. De to viktigste plattformene er massespektrometri (MS), ofte koblet med kromatografi, og kjernemagnetisk resonans (NMR)-spektroskopi. Disse teknologiene gjør det mulig å identifisere og kvantifisere hundrevis til tusenvis av ulike metabolitter samtidig fra en biologisk prøve, som blod, urin eller vev. Dataene som fremkommer, gir et detaljert kjemisk fingeravtrykk som gjenspeiler de pågående aktivitetene i organismen.
Kontekst
Metabolomikk har en unik plass i hierarkiet av systembiologi. Genomikk viser den genetiske blåkopien av hva som kan skje, og proteomikk identifiserer proteinene som produseres for å få ting til å skje. Metabolomikk måler derimot hva som faktisk har skjedd eller skjer akkurat nå på kjemisk nivå. Den regnes derfor som det «omikk»-feltet som er tettest knyttet til fenotypen, det vil si de observerbare trekkene og den fysiologiske tilstanden til en organisme. Ved å integrere metabolomiske data med informasjon fra genomikk og proteomikk kan forskere bygge et mer fullstendig og funksjonelt bilde av hvordan biologiske systemer fungerer, både i helse og sykdom.
Betydning
Den viktigste betydningen av metabolomikk ligger i potensialet til å revolusjonere medisin og diagnostikk. Ved å identifisere unike metabolske signaturer, eller «biomarkører», knyttet til bestemte sykdommer, gir feltet et kraftfullt verktøy for tidlig diagnose, prognose og oppfølging av behandlingsrespons. For eksempel kan spesifikke mønstre av metabolitter i blodet indikere forekomst av kreft, diabetes eller hjerte- og karsykdom lenge før kliniske symptomer oppstår. Metabolomikk er også avgjørende for persontilpasset medisin, og bidrar til å forutsi hvordan et enkeltindivid vil reagere på et bestemt legemiddel. Feltet spiller dessuten en viktig rolle i legemiddelutvikling, toksikologi og ernæringsvitenskap. Det gir dyp innsikt i hvordan ytre stoffer og kostholdsvalg påvirker menneskers helse på molekylært nivå.